Manu Gonzalez sukses memulai tur Asia dengan meraih pole position ketujuhnya musim ini dalam kelas Moto2. Dalam kualifikasi yang berlangsung di Twin Ring Motegi, Gonzalez berhasil mencatatkan waktu di bawah 1:48, yaitu 1:47,925. Sementara itu, pembalap Tim Aspar, Dani Holgado dan David Alonso, berada di posisi kedua dan ketiga. Diogo Moreira dan Aron Canet juga mencetak waktu yang mengesankan dalam kualifikasi tersebut.
Aron Canet kembali menjadi sorotan setelah masalah yang dialaminya pada hari sebelumnya. Filip Salac juga tampil impresif dengan waktu 1:48,564, mengungguli David Alonso. Posisi kedua dalam kualifikasi Moto2 direbut oleh Barry Baltus, disusul oleh Alonso Lopez. Sayangnya, pembalap seperti Marcos Ramirez, Senna Agius, dan Jorge Navarro tersingkir dari zona cut-off.
Dalam sesi Q2, Manu Gonzalez kembali melakukan start yang baik, meskipun mulai lebih awal dari yang seharusnya. Namun, David Alonso menjadi pembalap yang unggul dalam poin waktu dengan mencatatkan 1:46,129. Namun, Gonzalez akhirnya mampu menguasai sesi kualifikasi dengan mencatatkan waktu 1:47,925, menjadikannya satu-satunya pembalap yang berhasil melewati batas waktu 1:48. Daftar grid kualifikasi Moto2 di Motegi diisi oleh pembalap-pembalap ternama seperti Celestino Vietti, Diogo Moreira, dan Barry Baltus.
